蝙蝠这种生物，想搞明白它是怎么演化的，其实非常难。我们知道，想要搞明白一种生物的来龙去脉，最重要的依据就是化石了，没有化石证据，研究就无从谈起了。可是蝙蝠这种生物，其骨骼很脆弱，不易形成化石，所以直到如今，发现的蝙蝠化石数量极少，正是因为如此，还无法对蝙蝠的起源给出圆满的解释。
2003年，距今5200万年的蝙蝠化石被发现了，这表明在5200万年前就已经存在蝙蝠了。另一方面，从蝙蝠的化石来看，古蝙蝠的形态与如今的蝙蝠相差不大，科学家推测在那个时候，蝙蝠就已经可以飞翔了，且形态与现代蝙蝠相似，从图中的蝙蝠化石形态就可以轻易的看出与如今的蝙蝠没有多大分别。
难就难在这里，目前发现的最早蝙蝠化石距今有5500万年，从化石上来看，那个时候的蝙蝠与现今的蝙蝠差不多，都会飞行了，这样的结果说明不了什么问题，因为无法展现蝙蝠的演化历程，难道蝙蝠是刚一出现就会飞的吗？
还能不能发现比蝙蝠更早的能够飞行的哺乳动物呢？
2006年，我国科学家在内蒙古宁城发现了距今约1.25亿年的远古翔兽化石。远古翔兽也是哺乳动物，还是目前为止人类发现的最早的能够飞行的哺乳动物，它们生活在1.25亿年前的白垩纪早期，是与恐龙同时代的哺乳动物。从化石来看，远古翔兽体型非常小，体长12-14厘米，体重仅为70克左右，与一般的小老鼠差不多大，这次发现的化石保存得非常完整，可以了解到它全身覆有毛发，有翼膜，由尾巴和四肢支撑翼膜，这点与蝙蝠很相似。
最早的蝙蝠化石是5500万年前的，现在又发现了距今1.25亿年前的远古翔兽化石，这之间是不是有什么联系呢？它们都有翼膜，都可以飞，很自然的就让我们联想到了它可能是蝙蝠的祖先，即便不是祖先，也可能与之类似。
上面说到都可以飞，其实我说得并不严谨，从化石来看，远古翔兽还不会真正的飞行，它可以做到从一棵树滑翔到另一棵树上，它的翼膜只能用来滑翔，而如今的蝙蝠是真正的可以飞行。
虽然到如今还无法知道蝙蝠的祖先到底是什么，但从已有的证据来看，蝙蝠的祖先很可能是类似远古翔兽一样的动物，起初它们并不会真正的飞翔，它们只能够借助翼膜来完成树与树之间的滑翔，不断地演化，或者说是因为基因的突变，才得以掌握飞行。
蝙蝠的演化历史悠久，比人类祖先早出现于地球上，它们在这颗星球上已生活了数千万年甚至上亿年，由于其特殊的生理特性，蝙蝠身上携带了大量的病毒，这些病毒在蝙蝠身上不会发病，这并不是因为蝙蝠的免疫力强，而是因为蝙蝠的体温高以及其本身特殊的免疫应答系统，并且蝙蝠还具有DNA损伤修复能力。虽然蝙蝠是“移动的病毒库”，但蝙蝠生活的地区与人类聚集区没有多少重叠，且蝙蝠是夜行性动物，所以只要我们做到拒绝野味，就可以有效地防止病毒感染。
